Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms