Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIBQ01892 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.8 ms