Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF5P84085 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms