Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms