Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVPABLB-1P60509 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms