Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms