Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP107P57740 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP107P57740 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms