Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms