Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms