Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMSP52788 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMSP52788 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMSP52788 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms