Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLCN5P51795 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms