Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FNTAP49354 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTAP49354 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms