Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRCC3P46736 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms