Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRXP46100 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRXP46100 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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