Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC1P35052 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms