Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC13P31276 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms