Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR4A1P22736 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms