Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNNI3P19429 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms