Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB6P18564 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB6P18564 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms