Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSPP15924 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DSPP15924 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSPP15924 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms