Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PAPLNO95428 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms