Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AKAP8O43823 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms