Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DENRO43583 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DENRO43583 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms