Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms