Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL13PA6NNM8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms