Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms