Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AFG3L2Q9Y4W6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms