Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4BQ9Y4P1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms