Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERGIC3Q9Y282 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERGIC3Q9Y282 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERGIC3Q9Y282 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERGIC3Q9Y282 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ERGIC3Q9Y282 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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