Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.6 ms