Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms