Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRBP1Q9P2E9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms