Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms