Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FANCFQ9NPI8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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