Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLIRPQ9GZT3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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