Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms