Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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