Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC8Q8TC99 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms