Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF439Q8NDP4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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