Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTC29Q8NA56 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTC29Q8NA56 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TTC29Q8NA56 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TTC29Q8NA56 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TTC29Q8NA56 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TTC29Q8NA56 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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