Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VSTM1Q6UX27 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms