Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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