Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms