Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms