Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP170Q5SW79 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms