Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms