Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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