Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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