Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZIC1Q15915 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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