Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC1A5Q15758 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC1A5Q15758 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms